关于

了解 Mol2Mat:浏览器分子与晶体计算、硅响应与声子、构象搜索、反应预测及材料分析。

在浏览器里,完成分子与晶体计算、反应研究和材料分析。

功能与规模

Mol2Mat 免费提供本机科学计算与开放数据检索。名称、SMILES、绘图和已有三维构型连接到同一工作台,结构、计算结果与来源记录可以接着用于比较、分析和导出。

分子结构与性质

GFN2-xTB 几何优化与电子性质、CREST 构象搜索,以及分子轨道、电荷、偶极、Mayer 键级、振动与红外光谱。构象集合可用于性质和光谱的加权分析。

常规 GFN2 与 CREST 输入上限为 1,024 个原子(含氢);指定主族结构、开壳层与溶剂组合的扩展计算支持至多 32 原子。

DFT 电子结构

JDFTx 平面波 PBE 在浏览器中计算能量、原子力与周期应力,支持原子位置优化、晶胞优化和共线自旋极化。固定晶胞硅计算还提供密度响应、Γ 点声子与价带电子–声子耦合,技术文章给出相应方法和数值对照。

单点计算覆盖 H₂O、NH₄⁺、金刚石 Si、岩盐 MgO、fcc Al 和 bcc Fe;原子位置优化覆盖 H₂O、NH₄⁺、Si 和 MgO,晶胞优化采用 fcc Al。各体系保留对应的电荷、自旋、采样与收敛条件。

JDFTx 浏览器实现与数值验证

反应预测与动力学

ASKCOS 原始 FP32 模型在浏览器生成排序产物候选,结构可继续进入分子计算。VTNA / Auto-VTNA 分析浓度–时间数据、比较动力学曲线并搜索经验反应级数。

预测输入最多 8 项反应物与试剂、合计 100 个重原子,返回至多 5 个候选;VTNA 支持 4 组实验、共 500 个观测。

ASKCOS 浏览器实现与验证

多步合成规划

AiZynthFinder 在浏览器完成策略推理、反应模板应用与树搜索,将目标分子连接到可查询的原料库。路线中的前体可直接用于后续研究。

原料库含 17,422,831 个完整 InChIKey,按需加载并精确判断库存归属;路线搜索最多 5 步。

AiZynthFinder 浏览器实现与验证

材料与实验分析

浏览器计算晶体粉末 XRD,联动晶体结构与峰表;同时提供光学、力学、热学、输运、相平衡、曲线拟合与测量不确定度分析。

粉末 XRD 支持至多 200 个显式晶体学位点,散射数据覆盖 H–Cf。物质、反应与材料记录连接 PubChem、ORD、COD、JARVIS 等开放来源。

粉末 XRD 浏览器实现与验证

计算记录与后续分析

计算记录保留输入、方法、参数与结果,可恢复、对比和导出。三维结构与定量图形共用可交互画布,已有对象可直接衔接后续工具。

本机计算

本机执行

分子与周期晶体计算、构象搜索、反应预测与数据分析直接使用本机算力。科学引擎按需加载到浏览器,计算过程、三维结构和结果在同一工作区呈现。

工具之间

GFN2-xTB、CREST、JDFTx、ASKCOS、AiZynthFinder 与 Auto-VTNA 已接入统一流程,结合双精度数值计算、原始 FP32 模型与多核并行。名称、绘图、已有结构和计算结果可在工具之间衔接。

保存与恢复

本机计算的结构与数值结果保存在设备上,记录可回看、恢复和导出。引擎下载、名称解析与开放数据库检索按需联网。

阅读博客

项目与来源

Mol2Mat 由 Felix Fei 独立创立、设计与开发,工作涵盖科学引擎的浏览器移植、数值验证、性能优化、数据接入和产品设计。博客持续记录实现、实测结果与研究进展。

Felix Fei
[email protected]

开放数据库连接亿级化合物结构、已报道反应、晶体及材料物性。记录保留数据库标识、原始文献与测量或计算条件。

依据与引用

结果标明实验、计算或预测来源,方法、条件与数值对照随记录及技术文章提供。

引用结果时,注明原始文献或数据库标识、方法、条件与访问日期;计算记录和导出保留已记录的引擎或模型版本。

数据来源

PubChem

化合物结构与标识符

Open Reaction Database

实验反应与已报道条件

Rhea

生化方程与酶关联

NIST Ceramic Data Portal

陶瓷弹性性质与文献表格

NIST Cryogenic Materials Properties

热物性与热膨胀关联式

refractiveindex.info

光学常数与色散模型

Crystallography Open Database

已发表晶体结构

Alexandria PBE

计算晶体结构与能量

NIST JARVIS-DFT

计算体相与二维材料

AFLOW AEL

计算弹性张量与模量

国家教育研究院 · 化学英中词表 · 政府资料开放授权条款第 1 版